Собиранием книг Геннадий Юдин увлекся в отрочестве. В письмах к родным он признавался, что из тех заработанных денег, которые он тратил на себя, большая часть уходила на покупку книг. Юный Юдин выписывал все газеты и журналы, которые могли получать в Минусинске, где жила тогда его семья. По-видимому, определенное влияние на увлеченность книгой на него оказало знакомство с минусинскими декабристами И. Киреевым и братьями Крюковыми. Окончив в 1858 году гимназию, Геннадий поступил на работу кладовщиком на Ачинский винный склад. Он был очень бережлив, зря не тратил ни копейки. Единственным, на что он не жалел денег, были книги и журналы.
Выигрыш по займу 100 тыс. рублей способствовал укреплению материального положения начинающего предпринимателя и позволил со всей страстью отдаться коллекционированию редких книжных изданий. Во время поездок в Петербург и пребывания за границей Геннадий Васильевич посещает лучшие антикварные и книжные магазины, знакомится с издателями, библиографами, известными учеными, писателями. Со многими из них Юдин переписывался до конца своих дней.
За сорок лет коллекционирования Юдин собрал свыше 100 тысяч книг на русском, немецком, французском, английском, латинском, греческом языках, затратив на приобретение коллекции в общей сложности около 500 тысяч рублей. В итоге он собрал уникальную библиотеку. По численности и содержанию библиотека Юдина среди частных библиотек не имела себе равных не только в Сибири, но и во всей России.
Для библиотеки Геннадий Васильевич выстроил отдельный двухэтажный деревянный дом на окраине Красноярска, в Таракановке. Рядом размещалось отдельное здание для хранения архивных документов. Юдин тщательно следил, чтобы помещения были надёжны и добротны. Чтобы книги и рукописи могли «дышать», он не разрешил строителям оштукатурить стены. Специально были изготовлены просторные шкафы, плотно закрытые стеклом. Отдельная комната была отведена под библиографический отдел, где находились каталожные ящики и справочные издания.
В библиотеке Геннадия Васильевича были все сколько-нибудь важные сочинения русских историков и критиков от Татищева и Карамзина до Погодина, Соловьева, Костомарова и Ключевского. Она содержала полный комплект русских летописей, опубликованных историческим и археологическим обществом. Библиотека была очень богата книгами по местной и общей истории и этнографии. Коллекция содержала в себе лучшие издания всех важнейших русских писателей, комплекты журналов 18-19 столетий, иностранные книги, посвященные России.
Особый интерес проявлял Юдин к изданиям, запрещенным цензурой. Так, в его коллекции был один из немногочисленных экземпляров первого издания книги А.Н. Радищева «Путешествие из Петербурга в Москву», произведения революционера Берви-Флеровского «Азбука социальных наук», «Положение рабочего класса в России», тираж которых был почти полностью пущен «под нож».
Частью коллекции Юдина был достаточно богатый рукописный отдел. Собирать архивные материалы Геннадий Васильевич начал еще в 60-х годах, но приступить к их описанию стало возможным лишь в 1890 г. Это было осуществлено известным сибирским архивистом и историком Н.Н. Бакаем, опубликовавшим в 1896 г. брошюру «Замечательное хранилище Восточной Сибири». Наибольшую ценность среди архивных материалов юдинской коллекции представляли личная переписка русского полководца А.В. Суворова, автора «Конька-Горбунка» П. Ершова, различные материалы, связанные с жизнью и деятельностью Л.Н. Толстого, письма декабриста Завалишина, краеведа Турчанинова, бумаги основателей Русской Америки Шелехова и Резанова. Большую часть архивной коллекции Юдина составляли ценные материалы по истории Сибири: рукописи о древних походах русских землепроходцев, записи о древних картах Сибири, указы Тобольской архиерейской канцелярии, указы провинциального магистрата и другие. Был у Юдина и ценный фотоархив, включавший в себя фотографии видов и улиц сибирских городов, фотопортреты местных писателей, ученых и журналистов, ссыльных революционеров.
Хранение огромного книжного собрания требовало немалых денежных затрат, которые со временем стали для сибирского купца слишком обременительными из-за пошатнувшегося финансового положения. В одном из своих писем Юдин писал: «Если бы я располагал достаточными финансовыми средствами, и дела мои были бы в прежнем цветущем состоянии, я, в мои преклонные годы, отдал бы мои книги, по русскому обычаю, в одно из наших общественных учреждений. К сожалению, я не имею возможности так поступить, несмотря на все мое желание...».
В конце 1890-х годов Юдин начинает задумываться о продаже библиотеки. Он несколько раз обращался в официальные инстанции со своими предложениями, давал объявления в газеты о продаже библиотеки. В 1903 году для ознакомления с библиотекой в Красноярск прибыл заведующий славянским отделом Библиотеки Конгресса США А. Бабин. 8 февраля 1904 года Юдин официально предложил Библиотеке Конгресса в Вашингтоне купить у него книги, а окончательное соглашение было подписано 3 ноября 1906 года. При продаже Геннадий Васильевич выставил несколько условий: чтобы его коллекция хранилась в Библиотеке Конгресса в отдельном помещении, чтобы его книги были каталогизированы и снабжены книжными знаками Г.В. Юдина. За 100 тысяч рублей американцами было куплено около 81 тысячи томов книг и часть рукописей, относившихся к истории Аляски.
Геннадий Васильевич очень тяжело переживал продажу своего любимого детища. До своей кончины в 1912 году он собрал еще около 10 тысяч книг. После смерти Юдина книги хранились у его наследников, а в 1920 году были национализированы и перевезены в только что созданное Енисейское центральное книгохранилище. В 1920-1921 годах работа по учету и обработке фондов в этом учреждении велась активно, но затем финансирование и штат были сокращены, начатые работы приостановлены. Большой массив неучтенных и необработанных фондов на долгие годы был уложен для хранения.
В 1935 году книжные запасы бывшего Енисейского центрального книгохранилища, в том числе около 10 тысяч томов из второй домашней библиотеки Юдина, были переданы в только что образованную Красноярскую краевую библиотеку. Архивные материалы в конце 1940-х гг. были перенесены в Москву и остались в Центральном государственном архиве литературы и искусства (ЦГАЛИ). Часть документов была разделена между архивами 35 областей и 5 автономных республик, входящих в состав СССР, а также архивами 6ывших союзных республик, теперь - зарубежных государств.
На 1 января 2010 г. Юдинское собрание Государственной универсальной научной библиотеки Красноярского края насчитывает 9919 единиц хранения, из них 1642 журнала.
